高一不参加军训扣学分不影响高考，但对综合素质评价和毕业证有影响，新高考录取是要参考综合素质评价的，军训是高中生的一门必修课，要参加军训才能取得相应学分，综合素质评价里也有军训的相关内容，如果被扣分是要补回来的，以免影响高考录取。
高一新生不参加军训有什么影响
高一新生不军训的后果是学校严格的话会影响学分，学分制是如果你没有在高中三年的学习中修满它所要求的学分的话，会拿不到毕业证书。不过大多数学校都没有很严格的要求这方面。
高一开学军训建议能参加就尽量参加，否则正式开学后面对完全没印象的老师、同学会显得很尴尬，而且容易被同学排斥。
高中军训有哪些注意事项
1、饮食生活：高一军训前，不要吃太多大鱼大肉。鱼生火肉生痰，内热遇外感，军训时容易感冒发烧。另外，在军训开始前两周注意逐步调整作息节律（早睡早起、中午可午休，与军训作息时间保持一致），勿太劳累，也不要整天处于空调环境中。不妨通过适度运动（游泳、跑步、骑车、打球等）锻炼身体，以迎接军训的考验。
2、个人卫生：高一军训前，男生最好理个短发，否则军训时会太热。女生要将头发扎起来。
3、防暑灭蚊及消炎药品：必不可少的物品是蚊虫叮咬剂，带花露水，还有带点防暑药，白花油啊，驱蚊止痒又有醒神功效。准备好红霉素之类的消炎药，皮肤浸过汗水很脆弱容易破皮。
4、其他：准备点茶叶，创可贴，还有一包针线，高中军训期间难免磕磕碰碰，万一划伤了，衣服破了等等，这些就派的上用场了。