第一、发生在减数第一次分裂的间期，同源染色体的非姐妹染色单体的交叉互换。第二、发生在减数第一次分裂后期。还有第三个就是基因工程里面的，插入外来的基因。
基因重组发生的时期
1.因重组指在生物体进行有性生殖的过程中，控制不同性状的基因重新组合。其发生在二倍体生物的每个时代中。
2.在减数分裂的第一次分裂后期，随着非同源染色体的自由组合，非等位基因也自由组合；在减数分裂的四分体期，由于非姐妹染色单体的交叉互换，打破了原有基因的连锁关系而产生基因重组；重组DNA技术，在DNA复制时，没有基因组合的改变。
作物抗逆性品种、高产品种定向选育，重组抗原抗体制备，重组蛋白表达，工业微生物育种，科学研究等。基因的自由组合（发生在减数第一次分裂后期）、基因的交叉与互换（发生在减数第一次分裂前期）、基因工程和细菌转化（如肺炎双球菌由R型转化为S型）。其中，前两种是狭义的基因重组，后两种是广义的基因重组。
基因重组各类型的意义
是生物变异的重要因素,是生物进化重要因素之一。
1.同源染色体之间的非姐妹染色单体的交叉互换，同源染色体的非姐妹染色单体在前期联会。
2.非同源染色体上的非等位基因的自由组合，减一后期，同源染色体上的等位基因分离，同时非同源染色体上的非等位基因自由组合
（1）接合作用：当细胞与细胞、或细菌通过菌毛相互接触时，质粒DNA就可从一个细胞（细菌）转移至另一细胞(细菌），这种类型的DNA转移称为接合作用（conjugation ）。