学校办学基础优良。建有基础医学院、临床医学系等21个学院（系、部）；开设临床医学、口腔医学、麻醉学等22个本科专业，医学影像学为国家级特色建设专业；有省级精品课程10门，省级精品资源共享课程9门，省级精品在线开放课程4门；有基础医学实验教学中心、医学影像学实验中心2个省级实验教学示范中心。建有南充顺庆、南充高坪两个校区，3所直属附属医院和24所非直属附属医院，53所教学实习医院。