坚持“自动化工程，船舶控制工程”的专业特色，融合英国先进的创新型本科人才培养模式和英国南安普顿大学在船舶海洋及控制工程领域的优势，以“坚实基础、学科前沿、国际视野”为课程教学目标，课程融入国际前沿成果、先进教学理念、国际规则和技能、异域文化、外语授课等诸多要素，中外双方教师共同承担课程的讲授任务。培养适应国际社会船舶工业、海军装备、海洋工程、控制工程领域发展需要的复合型国际化创新人才。
毕业生去向主要是航海、造船、航空、航天及各种含自动化、计算机技术领域的国内外研究设计和生产单位。世界各大船级社和国际船舶公司也是联合学院培养的自动化专业学生就业的主要渠道之一。