院系设置
少年班学院
数学科学学院
数学系
计算与应用数学系
概率统计系(筹)
物理学院
物理系
近代物理系
光学与光学工程系
天文学系
工程与应用物理系
化学与材料科学学院
化学物理系
应用化学系
材料科学与工程系
化学系
高分子科学与工程系
工程科学学院
近代力学系
精密机械与精密仪器系
热科学和能源工程系
安全科学与工程系
信息科学技术学院
电子工程与信息科学系
自动化系
电子科学与技术系
信息安全专业
地球和空间科学学院
地球物理与行星科学技术系
地球化学与环境科学系
生命科学与医学部
生命科学学院
分子生物学与细胞生物学系
神经生物学与生物物理学系
系统生物系
医药生物技术系
附属第一医院
计算机科学与技术学院
管理学院
工商管理系
管理科学系
统计与金融系
公共事务学院
人文与社会科学学院
外语系
马克思主义理论教学研究部
人文素质教学研究部
科技哲学教研部
体育教学部
科技史与科技考古系
科技传播与科技政策系
现代艺术中心
大数据学院
材料科学与工程学院(中国科学院金属研究所)
天文与空间科学学院(紫金山天文台)
纳米技术与纳米仿生学院(苏州纳米所)
应用化学与工程学院(长春应化所)
核科学技术学院
环境科学与光电技术学院
马克思主义学院(中共安徽省委党校共建)
微电子学院(长春光学精密机械与物理研究所共建)
软件学院
苏州研究院
上海研究院
北京研究院
先进技术研究院
国家同步辐射实验室
合肥微尺度物质科学国家研究中心
火灾科学国家重点实验室
量子信息与量子科技前沿协同创新中心
核探测与核电子学国家重点实验室
北京教学与管理部